各結膜上皮障害の原因としては内因性疾患であるシェーグレン症候群、皮膚粘膜眼症候群（スティーブンス・ジョンソン症候群）、乾燥眼症候群と外因性疾患である手術後、薬剤性、外傷、コンタクトレンズ装用などがある。